Продолжение мультфильма начинается с неожиданного поворота сюжета: Шрэк и Фиона возвращаются домой после сказочного медового месяца и обнаруживают письмо от родителей принцессы с приглашением на ужин. Маму-королеву и папу-короля ждет пренепреятнейший сюрприз, дочка-то обернулась троллем! Вместе с Осликом счастливая пара молодоженов отправляется в путешествие в Делекое Далекое Королевство. По ходу дела оказывается, что выручить Фиону из лап дракона должен был принц Чарминг, сын крестной-Феи девушки, которая заколдовала ее еще в детстве с рассчетом последующей свадьбы. А самовлюбленный нарцисс Чарминг хочет только одного – прибрать к рукам наследство принцессы. Они разрабатывают коварный план: убрать Шрэка с дороги и женить Фиону на нагловатом юноше. Для устранения противника Фея нанимает спеца по ограм – отважного Кота в сапогах.
