В основе сюжета картины лежат произведения Жюля Верна «20 000 лье под водой» и «Паровой дом». Герой фильма – знаменитый профессор Аронакс – отправлен в важную экспедицию. Он должен найти и уничтожить морское чудовище, которое расправляется с военными кораблями. Очень скоро карательный отряд находит монстра, но сражение на воде идет не так гладко и корабль профессора идет ко дну. Сам Аронакс вместе со слугой Конселем и китобоем Недом Лэндом волею судьбы попадают на загадочный подводный корабль «Наутилус». Оказывается, этот корабль они и принимали за морского монстра. Подводным судном управляет капитан Немо, который заявляет, что спасенные останутся на борту до конца дней своих, чтобы не разглашать тайну чудесного корабля.