После победы над заклятым врагом Шреддером Черепашки-ниндзя востребованы как никогда. Однако Рафаэль, Донателло и Микеланджело разбрелись кто куда. Леонардо поехал тренироваться в Центральную Америку, а Донателло и Микеланджело организовали собственный небольшой бизнес. Тем временем в Нью-Йорке происходят странные события, и полчище древних чудовищ грозит поработить мир. Черепашкам обязательно надо собраться, чтобы противостоять злу.
